专项审计是审计人员对被审单位特定事项进行的审核、稽查。如： 对企业的审计，只审查企业经济活动，如是否偷税、漏税。现金业务是否符合现金管理规定，某项经营是否合法、有效等等。专项审计如能与资金平衡表审计或详细审计配合，可以收到更好的效果。
通常情况下，专项审计包含离任审计、清算审计、改制审计、司法鉴定审计、财产转移审计、贷款审计、移民审计、年检审计、高新技术企业认定审计等。因此，笼统地讲，专项审计是对某种特定审计项目的总称专项审计。具体说明如下：
（1）离任审计。离任审计是指审计人员对法定代表人整个任职期间经济责任履行情况所进行的审查、鉴证和总体评价，其是考核责任人任职期间的业绩，明确划分前后任经济责任的有效方法。
（2）清算审计。清算审计是指企业由于各种原因终止，对其清算期间的债权债务清偿情况、资产变现情况、 清算期间的收益、损失、费用支出情况及清算截止日净资产分配情况进行的审计，以确认清算企业是否合法、公开、公正进行全部清算活动，并对清算结果发表合法、公允的审计意见。
（3）改制审计。改制审计是指全民所有制企业或集体所有制企业改变其所有权性质，通常是在变更为按《公司法》设立的有限责任公司中需要进行的审计。其具体包括初始投资认定审计、财产损失认定审计、财务状况认定审计。该审计报告可提供给财政局、工商局、企业上级单位等相关部门。
（4）司法鉴定审计。其是指在诉讼中接受法院、检察院、公安机关或当事人的委托，对涉及诉讼经济事项的事实、形成过程、原因及结果进行的专项审计。通常我们对这种审计实施特殊的审计程序，其结果具备法律效力。
（5）财产转移审计。财产转移审计对股东投入到公司的实物资产是否已移交给公司、是否已登记入账、并办理了相关财产转移手续进行的一种专项审计。该审计报告通常是提供给工商局办理登记的必要文件。
（6）贷款审计。贷款审计提供给银行，作为审查企业是否具备银行要求的贷款条件，以及对贷款使用情况进行的专项审计。在审计报告中不仅会对会计报表发表审计意见，同时也对企业经营管理状况、财务状况、贷款使用情况等发表意见。是银行规避贷款风险，企业展示经营状况必不可少的依据。